25 апреля 2002 года на Конгрессе УЕФА в Стокгольме, Казахстан стал 52-м членом европейской ассоциации футбола. С этого года у казахстанских клубов появилась возможность участвовать в европейских турнирах. Первопроходцами стали три клуба «Женис», «Атырау» и «Кайрат». Ни одной из команд не удалось даже одного отборочного раунда. В следующем году в еврокубках вновь стартовало три клуба – все тот же столичный «Женис», «Иртыш», «Атырау» и «Тобол». Костанайский клуб выиграл сразу четыре встречи подряд, и этот результат является непревзойденным в Казахстане. Такое удачное выступление «Тобола» заставило следующего соперника – австрийский клуб «Пашинг» отнестись к противостоянию с костанайцами со всей серьезностью.

В евросезоне 2006/07 «Тоболу» в Кубке УЕФА достался очень сильный соперник – «Базель», многократный чемпион Швейцарии. В составе соперника играли футболисты представляющие сборные разных стран, в том числе участников чемпионата мира 2006 года.

В 2007 году «Тобол» отметится до сих пор непревзойденным достижением в Казахстане – пройдет три отборочных стадии еврокубка.

 В 2008 и 2009 году в Кубке УЕФА и Лиге Европы «Тобол» будет встречаться с очень сильными европейскими клубами, уступать которым будет лишь на их поле.

Двадцать два матча с клубами из десяти стран сыграл «Тобол» в еврокубках, это самый большой показатель среди казахстанских команд. Из 22 поединков в восьми победа была на стороне «Тобола». По одной игре с «Базелем», «Слованом» и «Галатасараем» завершилось ничейным исходом. По 21 матчу сыграли – защитник Данияр Муканов и капитан Нурбол Жумаскалиев. Именно Нурбол забил и больше всего голов ворота соперников – 7. Кроме капитана еще десять футболистов являются авторами голом: по три Мазбаев и Балтиев, по одному - Шкурин, Муканов, Гаркуша, Котов, Бакаев, Остапенко, Харабара, Голбан.